The animatrix

1. Останній політ «Осіріса»
Команда дослідного корабля "Осіріс" виявляє армію вторгнення.

Поки один з членів команди проникає в Матрицю з метою доставки попередження, інші відчайдушно намагаються дати їй достатньо часу, борючись з натиском роботів-вартових.

2-3. Другий Ренесанс, частини 1-2
Люди намагаються створити ідеальний ІІ ( "Штучний Інтелект"), який не поступався б людині.

Але у взаєминах людей і машин виникають розбіжності, в результаті від протестів роботів і створення ними своєї держави конфлікт скочується до війни. Люди застосовують кліматичне зброю, щоб закривши небо хмарами, позбавити роботів основного джерела живлення. Але роботи знаходять інше джерело живлення - людей. В остаточному підсумку, люди програють цю війну, стаючи "живими батарейками", які потрапили в пастку Матриці.

4. Історія одного хлопця

Один підліток, прокинувшись від надреалістичний сну, розуміє, що все навколо - генерується Матрицею простір, а реальність - то що він бачив уві сні. За ним починають полює одягнені в однакові костюми люди. Він намагається втекти, користуючись допомогою Нео.

Дія епізоду відбувається в симуляції головної героїні Сис. виконаної в середньовічному японському стилі.

6. Світовий рекорд

Під час найважливішого для спортсмена забігу він перенапружується, отримує травму, але продовжує бігти, докладаючи надлюдські зусилля. Це позначається на його фізичному стані, виникає загроза того, що він прокинеться в реальному світі. Агенти, що вселилися в інших спортсменів, намагаються наздогнати його, але не можуть.

Ден прокидається в капсулі і бачить робота-збирача. Він перетинає фініш в Матриці з неймовірним результатом, але отримана на фініші додаткова травма позбавляє його частини рухових функцій, тому після цього він все-таки був залишений в живих Агентами. Однак, перебуваючи в інвалідному візку, Ден вирішує стати вільним і намагається перебороти Матрицю і встати на ноги.

7. По той бік
Під час пошуків своєї зниклої кішки дівчина знаходить дивний будинок і компанію дітей, що грають в ньому.

В цьому будинку спотворюється гравітація і відбуваються інші дивні речі. Тим часом Матриця зауважує «помилку рендеринга» в локації зі старим будинком, і туди висилається загін зачистки.

8. Історія детектива

Історія починається починається зі сцени в поїзді. Людина, одягнена в дусі детективних нуар-романів, в пом'ятому плащі і без капелюха, прикурює цигарку, направляючи на кого-то пістолет. Ця людина - Еш. приватний детектив. Далі слід передісторія, яка розповідає про його черговий роботі - пошуку таємничого хакера Трініті. Слідуючи за отриманими підказкам, він потрапляє на поїзд, де з'ясовується, що він занадто близько підійшов до таємниць Матриці, а через нього Агенти намагаються захопити Трініті. Еш розуміє, що Трініті - його шанс зрозуміти, що ж все-таки відбувається. Однак за ними вже послані «агенти» - люди в чорних окулярах, строго одягнені і з однаковими пістолетами. Відбиваючись від них, Еш сам мало не перетворюється в одного з них, і Трініті вирішує, що він «не впорався». Вона стріляє в нього і збирається йти. Але детектив каже їй услід, що хотів би піти з нею. Він звинувачує себе в тому, що не зміг пройти тест. Трініті заперечує, що «тест і вибір - не одне й те саме». Трініті зникає, вистрибуючи з поїзда в розбите вікно, а в вагон вбігають «агенти» - люди в чорному, які шукають Трініті і Еша. Останні кадри епізоду повторюють саме його початок. Еш наводить пістолет на агентів і розглядає їх.

Дія сюжету відбувається в далекому майбутньому, під час війни між людьми і машинами. Головним персонажем є робот моделі «Раннер», що виявився одним з перших серед машин, підключених до Матриці.