Кодон, наука, fandom powered by wikia
Кодон (кодує трінуклеотідамі) - одиниця генетичного коду. трійка нуклеотидних залишків (триплет) в ДНК або РНК. кодують включення однієї амінокислоти. Послідовність кодонів в гені визначає послідовність амінокислот у поліпептидному ланцюзі білка. кодованого цим геном.
Класифікація Правити
Оскільки існує 4 різних нуклеотиду, то загальне число кодонів дорівнює 64, з яких 61 кодують певні амінокислоти, а 3 залишилися кодону (UGA, UAG і UAA) сигналізують про зупинку трансляції поліпептидного ланцюга і називаються стоп-кодонами. Кодон UAG в іРНК носить ще назву Амбер-кодон. UGA - опал. а UAA - охра.
Під стартовим кодоном - мають на увазі триплети CUG, UUG і триплет AUG в мРНК. кодує метіонін. з якого починається утворення поліпептидного ланцюга в процесі трансляції. Для прокариотов стартовими кодонами так само є GUG і AUU.
Так як в процесі біосинтезу білка в поліпептидний ланцюг бере участь всього 20 амінокислот, то різні кодони можуть кодувати однакові амінокислоти, такі кодони прийнято називати ізоакцепторнимі кодонами.
Крім того, в генетиці прийнято виділяти кодон, при якому не відбувається включення амінокислоти в білок, його називають безглуздим кодоном або нонсенс-кодоном такими кодонами є стоп-кодони.
Таблиця кодонів Правити
Таблиця відображає 64 кодони і амінокислоти, відповідні кажому з них.
1-я
літера
Неканонічні значення кодонів Правити
Принаймні у 16 типів організмів генетичний код відрізняється від канонічного. Наприклад багато видів зелених водоростей Acetabularia транслюють стандартні стоп-кодони UAG і UAA в амінокислоту гліцин, а гриб Candida інтерпретує РНК-кодон CUG не як лейцин, а як серин. А у мітохондрій пекарських дріжджів (Saccharomyces cerevisiae) чотири з шести кодонів, зазвичай транслюються в лейцин, кодують треонін.
Існування таких варіацій свідчить про можливу еволюції генетичного коду.
Представники майже всіх трьох доменів живих організмів іноді прочитують стандартний стоп-кодон UGA як 21-ю амінокислоту селеноцистеїн. не відноситься до 20 стандартних. Селеноцистеїн утворюється при хімічній модифікації серину на стадії, коли останній ще не від'єднався від тРНК у складі рибосоми.
Аналогічно у представників двох доменів (архей і бактерій) стоп-кодон UAG прочитується як 22-я амінокислота піролізин.
Еволюція поглядів на кодони Правити
Почавши вивчати кодони спільно з Джеймсом Уотсоном в 1953 році Френсіс Крік зробив припущення, що тільки 20 кодонів мають значення, а решта 44 триплетів є безглуздими.
Код Крика не мав розділових знаків (стартових і степових кодонів), оскільки безглузді кодони були фактично невидимими для адаптерів, так що знак, який вказує на початок зчитування, був не потрібен. Ця концепція відразу отримала майже беззастережне визнання, але ненадовго, лише до тих пір, поки нові дані на початку 60-х років не виявили її неспроможність. Тоді експерименти показали, що кодони, що вважалися Криком безглуздими, можуть провокувати білковий синтез в пробірці, і до 1965 року був встановлений сенс всіх 64 триплетів. Виявилося, що деякі кодони просто-напросто надлишкові, тобто цілий ряд амінокислот кодується двома, чотирма або навіть шістьма триплету.