Закладка органів і взаємодія частин зародка
Наступний етап - формування тканин і органів зародка - пов'язаний з подальшою диференціюванням клітин. В першу чергу, з ендодерми утворюється третій зародковий листок - мезодерма, який починає вростати між екто і ентодерми, відокремлюючи їх один від одного. Потім у зародків хребетних тварин розпочинається формування нервової трубки і хорди. Нервова трубка утворюється на майбутній спинний стороні зародка шляхом впячивания ектодерми у вигляді жолобка. Краї жолобка про подальше зростаються, і він перетворюється в трубку, яка занурюється під ектодерму. Нервова трубка є зачатком спинного мозку. В цей же час під нервовою трубкою з ентодерми утворюється тяж клітин, який згодом формує хорду. Подальша диференціювання приводить до формування з ентодерми епітелію кишок, травних залоз, а також легких. З мезодерми утворюються кровоносна, видільна система, скелет, м'язи. З ектодерми крім нервової трубки утворюються органи чуття, покривний епітелій і придатки шкіри.
У процесі ембріонального розвитку одні тканини або органи зародка можуть впливати на розвиток інших, які перебувають поруч. Це вплив здійснюється шляхом складних біохімічних впливів одних частин зародка на інші. Такий вплив, що визначає напрямок розвитку, називається індукцією. Якщо пересадити зачаток ока, взятого у одного зародка, під ектодерму іншого зародка, з останньої розвивається кришталик додаткового ока. В цьому випадку пересаджений ділянку індукував диференціювання клітин ектодерми в зачаток кришталика. Індукцію можна спостерігати при пересадці спинного краю бластопора одного зародка на стадії гаструли іншому на тій же стадії. Ця ділянка бластопора є індуктором утворення осьових органів зародка - хорди і нервової трубки. В результаті у зародка утворюються два комплекси осьових органів - один під впливом власного краю бластопора, інший-під впливом пересадженого. У деяких випадках при цьому вдається отримати два зрощених разом зародка.
Ембріональний період закінчується виходом зародка з яєчних оболонок. Далі починається постембріональний розвиток, який характеризується переходом організму до самостійного живлення і активного руху.