Захисні групи - довідник хіміка 21

Способи захисту бічних ланцюгів різних амінокислот не обговорюються в цій книзі. оскільки вони докладно описані в підручниках і монографіях (див, цитовану літературу). Більш важливим є знайомство з хімічними основами методів блокування аміно- і карбоксигрупи, що дозволяє зробити висновки про принципи блокування бічних ланцюгів. Часто для цього використовуються одні й ті ж або дуже схожі захисні групи. Як приклад розглянемо блокування тіогруппи цистеїну і аминогрупп орнитина і лізину, [c.78]

Оскільки кожна амінокислота приєднується по черзі, при хімічному синтезі білків дуже важливий вихід на кожній стадії. Знову звертаючись до синтезу Gly-Ala, відзначимо, що, якщо синтез пептидного зв'язку пройшов на 90%, такий синтез може вважатися задовільним. Однак, якщо ті ж умови використані для синтезу декапептиду грамицидина S, то загальний вихід складе 0,9 X 100% = 35%. При цьому не враховуються втрати при введенні і зняття захисних груп. Отже, при синтезі білкових макромолекул освіту пептидного зв'язку має проходити з високим виходом. [C.68]

В результаті кип'ятіння суміші 2-хлорціклогексанона з фенолом в бензолі, водного гідроксиду натрію і невеликої кількості аліквата 336 Піккер [246] виділив 58% 2-феноксіціклогекса-нона К. При цьому звичайного продукту реакції Фаворського виявлено не було (схема 3.45). В сполуки типу L і М можна ввести метоксіметільную захисну групу. якщо провести реакцію калієвої солі відповідного фенолу з хлордіме-тілові ефіром в ацетонітрилі в присутності 10 мовляв.% 18-крауна-6 при кімнатній температурі [241]. [C.156]

Класичний метод видалення фталильная групи - обробка гідразінгід-ратом в воді або етанолі. Побічний продукт. гідразид, відділяється при осадженні. Гідразін- хороший нуклеофил (так званий а-ефект), атакуючий ангідрідоподобную фталильная угруповання в умовах, при яких не будуть зачіпатися пептидні зв'язку. Проте при наявності ефірних зв'язків існує небезпека гідразіноліза. На інші захисні групи обробка гидразином не впливає. Обробка гидразином в гідроксилвмісних розчинниках може бути замінена обробкою фенилгидразином в інших органічних розчинниках. причому в цьому випадку гідразид залишається в розчині, а амінокислота випадає в осад. [C.74]

Металоорганічна захисна група (пентакарбоніл [метокси (феніл) кар-бен] хром (0))) була запропонована для захисту аміногрупи. Вона легко видаляється обробкою тріфторуксусіой кислотою при кімнатній температурі. Аминогруппу блокувати також, сульфіруя за допомогою о-нітрофенілсульфохлоріда. Деблокування відбувається під дією НС1, однак нітрофенілсульфопро-похідних амінокислоти слід зберігати у вигляді солі. оскільки похідне вільної кислоти нестабільно. [C.76]

У загальному випадку це досягається етерифікацією карбоксильної групи. що підлягає захисту. Для отримання метилового або етилового ефіру обробляють амінокислоту метанолом або етанолом, насиченим НС1 (етерифікація по Фіщеру). Однак зазвичай вважають за краще ефіри, гідроліз яких легко провести в м'яких умовах. Хоча ефіри омиляются підставами набагато легше, ніж пептиди (оскільки алкоксиди - лучще йдуть групи), що використовуються для цього лужні умови не можна застосовувати для деблокування поліпептидів. Використання бензи-лових ефірів дозволяє видаляти захисні групи при нейтральних умовах за допомогою каталітичного гідрування. Бензи-ловие ефіри синтезують з кислоти і бензилового спирту в присутності кислоти або тіоіілхлоріда (який переводить спирт в сульфохлорид, і вже останній заміщається кислотою), [c.77]

З трьох груп, які необхідно захищати (аминогруппа, фосфатна і гідроксильна), блокування гідроксилу найбільш важливо для зведення до мінімуму виходу побічних продуктів і ізомерів. Тому було запропоновано багато захисних груп для блокування гідроксилу. Така різноманітність дуже корисно, оскільки може виникнути необхідність введення в одну молекулу двох різних гідроксілблокірующіх груп. Зазвичай це буває потрібно при обробці 5 -гідроксільной (первинної) групи окремо від вторинних. У разі рібонуклеотндов вибірково впливати на 2 - і З вторинний гідроксильні групи складніше, так як вони мають подібні хімічні властивості. [C.158]

На основі відомостей про різні захисних групах, придатних для блокування гідроксильних і аминогрупп, можна синтезувати захищені нуклеозиди, в яких реакційно здатні групи утворюють тільки 3, -фосфодіефірную зв'язок. Небажані продукти (3, 3 - або 5, 5 -фосфодіефіри. ФОСФО-аміди і т. П.), Швидше за все не утворюються. Показовий при- [c.166]

Новітній огляд. присвячений використанню фотоактівіруемих захисних груп в органічному (аминокислотном, нуклеотидном) синтезі, см. роботу [362]. [C.166]

Після завершення реакції захисні групи можна видалити в м'яких умовах. що не зачіпають фосфодіефірних зв'язку. На цьому заснований фосфодіефірнимі метод синтезу полінуклеотидів. Продукт реакції - фосфодіефір з вільною, потенційно вразливою для впливу, негативно зарядженої групою. Далі, зі збільшенням довжини полінуклеотидних ланцюга число негативних зарядів в з'єднанні також буде збільшуватися. Тому в залежності від умов реакції ці потенційно нуклеофільниє центри можуть брати участь в небажаних побічних реакціях. Крім того, таке многозарядное з'єднання сліщком полярно, щоб можна було проводити його очищення звичайними методами органічної хімії. наприклад за допомогою хроматографії на силікагелі. Замість цього необхідно використовувати хроматографію на іонообмінних носіях, що володіють меншою ємністю (наприклад, на ДЕАЕ-целюлозі). Фосфодіефірнимі метод придатний для отримання речовин лише в невеликих кількостях. Однак нейтралізація зарядів шляхом етеріфі-кации відповідними захисними групами перед фосфорілірова-ням нуклеозидов усуває проблеми, згадані вище. В цьому випадку продуктом реакції конденсації є фосфотріефір. Фосфотріефірний метод дозволяє працювати з великими кількостями речовин. Нижче описані деякі захисні групи, які використовуються для блокування фосфату. [C.167]

Саме захищений фосфорилюються агент і реягірует з нуклеозидами з утворенням 3, 5 -фосфодіефірной зв'язку. Після завершення реакції трихлор-етільний захисна група може бути видалена декількома способами класичний - це обробка цинком, але можна використовувати і фторид тетрабутіл-амонію [c.168]

Як і в випадку 2,2,2-тріхлоретільной групи, видалення захисної групи можна домогтися обробкою фторидами або гідроксидом натрію. Очевидно, хлорфеніль-ва група є найкращою групою, що йде, ніж фе / гальная. Атака фторид-іоном також протікає з проміжним освіту фторфосфата. [C.169]

Небажаних побічних процесом. що відбувається при полінуклеотидні синтезі тріефірним методом (т. е. при синтезі довших, ніж дінуклеотід, олігомерів), є розщеплення межнуклеотидной зв'язків. Воно спостерігається в значній мірі при видаленні ароматичних захисних груп обробкою лугом або фторид-іоном [c.169]

Виходячи з кіслотолабільного фосфаміду, можна припустити, що вони виявляться потенційно корисними в якості захисних груп. І дійсно, добре відома анілідная захист, яку можна ввести і видалити [c.170]

Аналогічний швидкий метод синтезу можливий також і для рибонуклеотидов, як показано на прикладі освіти уріділіл- (3 -> 5) -урідіна. У цьому випадку як тріхлоретільная, так і сілільная захисні групи можуть бути одночасно видалені при розчиненні триефірів в розчині фториду тетрабутиламонію в тетрагідрофурані. [C.180]